時光流轉，三年後———雷伊以學院唯一的普通家庭（Ordinary）出身，進入了聚集全世界菁英魔術師的亞諾爾德魔術學院。入學之初，雷伊受到貴族出身的魔術師們輕蔑的目光。然而在挺身對抗盯上菁英魔術師的組織「優生機關（Eugenics）」的陰謀過程中，他向周遭證明了實力，逐漸贏得信賴。歷經重重試煉，在學院找到無可取代的夥伴與自己的歸屬之後，雷伊接下來將挑戰的，是跨越學院界線，由三人組成一隊進行對戰的大規模魔術戰（Magics War）！然而，不祥的陰影也正悄悄逼近雷伊與他的夥伴們……

大家一起殲滅了皮下真率領的犯罪組織「蒲公英」，「夜櫻前線」順利成功，接著還一併舉辦了太陽與六美的婚宴，夜櫻家迎來了安穩的日常生活…… 然而卻冒出了新任務？某天，太陽在夢中與夜櫻家初代當家夜櫻蕾進行對話。她表示為了達成「殺了我」的這個願望，有兩個不可或缺的事物。聽從蕾說的話，為了接觸掌握關鍵的皮下，太陽要挑戰銀級特務考試，但是有傳言指「今年不會有任何人合格」，最兇狠的考官們正在等著他！然後露出無畏笑容，六美她們的父親夜櫻百終於動了起來，身上帶有重重謎團的他，究竟有何目的？各式各樣的事

前往甲子園的最後一哩路澤村榮純背負起青道高中棒球隊的王牌背號，二年級的夏天再度揭開序幕。 將不甘化為力量，一步一步持續成長的澤村。 因傷勢與狀態起伏，而將王牌背號託付給澤村的降谷。 以及身為青道隊長，以壓倒性的存在感成為支撐全隊核心支柱的御幸。 澤村、降谷、御幸共同奮鬥的最後一個夏天。 他們的英姿與激戰，盡在眼前。