時光流轉，三年後———雷伊以學院唯一的普通家庭（Ordinary）出身，進入了聚集全世界菁英魔術師的亞諾爾德魔術學院。入學之初，雷伊受到貴族出身的魔術師們輕蔑的目光。然而在挺身對抗盯上菁英魔術師的組織「優生機關（Eugenics）」的陰謀過程中，他向周遭證明了實力，逐漸贏得信賴。歷經重重試煉，在學院找到無可取代的夥伴與自己的歸屬之後，雷伊接下來將挑戰的，是跨越學院界線，由三人組成一隊進行對戰的大規模魔術戰（Magics War）！然而，不祥的陰影也正悄悄逼近雷伊與他的夥伴們……此外，雷伊以外的其他七大魔術師，也陸續開始有所行動！？最強魔術師充滿友情與波瀾的學園生活，如今再度揭幕！！